有机肥就是猪粪牛粪等动植物的尸体或排泄物或废弃物，经过腐熟发酵而成的含碳物料，能以提供植物营养为其主要功能，作为有机肥，微生物的重要性以前一直不被农民所重视，由于传统农业中没有化肥农药的参与，土壤中自然存在的微生物菌群数基本都能应付植物种植的需要，采用轮作休耕等方式微生物会得到自然补充。

　　事实上所谓的宝地，都是特别适合微生物生长环境的土壤。没有微生物的参与，植物对营养的吸收只有20-30%，然而通过微生物的转换后，植物吸收率就会达到80-90%.没有办法不高产。而且现在国内进来了不少的菌剂菌种本身还带有抑菌增根生长调节作用，甚至带有抵御根结线虫的微生物，作为想从事低成本运作有机种植者，运用微生物菌是必须的。

　　微生物菌肥是不可或缺的农资产品，使用微生物菌肥能轻松解决很多化学农业恶性循环劳民伤财永远也做不完的工作，如杀抑菌工作，杀地下虫害工作，重金属污染问题，土壤板结，壮根健苗问题等，以及基本的提高植物吸收率，减少化肥用量达到食品安全度不超标的目的。因为任何微生物菌肥都有抢占有害菌生存空间的功能，对有害菌都能起到限制的效果，缓释肥效也是微生物菌肥的特点。

　　无论是从种植时间段上还是从需要的肥料类型上甚至包括虫害防治等很多方面都是以简单的轮作来解决各类问题是简单直接的生态种植理念，而且植物生长过程中在根部还会释放出各类或酸或碱的物质甚至是毒素，造成土壤ph值的改变，为有害菌的繁殖创造了生存环境。因此合理的轮作间作是有机种植必须遵循的自然规律。

　　使用微生物菌肥后，你必须与市场上的各类杀菌剂说再见了，微生物菌肥就是菌，你不会一边使用菌肥一边再去找杀菌剂去对付自己投入的菌吧，因为微生物是有生命的，你一旦使用了杀菌剂，你的微生物菌肥就什么效果也没有了，所以千万别再考虑使用。同时使用了菌肥就要考虑给菌创造适合的生存环境，和腐熟的有机肥混用是确保微生物生存简单方便的方式。